關稅自主權是獨立主權國家所擁有的權力，但清末時期關稅必須由貿易雙方進行協定，而無法以單邊決定，稱作「協定關稅」，是對清廷關稅自主權的剝奪。《南京條約》在西元 1842 年（道光 22 年）簽訂，內容便約定關稅必須由雙方議定，其後在片面最惠國待遇條款中，其他列強也同樣取得協定關稅的權力。此種議定關稅的不平等狀態，直到北伐成功後才逐漸去除。
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