同稱：「自體免疫疾病」、「自體免疫」。免疫系統的自我辨識功能發生問題，致使免疫系統針對自身的組織與器官產生異常免疫反應而引起疾病。 發生原因不明，可能與遺傳有關，也可能是某些感染性疾病所引起的併發症。 例子：紅斑性狼瘡、類風溼性關節炎等。
紅斑性狼瘡類風溼性關節炎橋本氏甲狀腺炎胰島素依賴性糖尿病風溼熱重症肌無力尼安德人針狀葉焰細胞光學顯微鏡腎孔多層柱狀上皮組織鱗葉多層鱗狀上皮組織載物臺測微器厭氧菌腸脂酶單棲固氮偽裝生態工法動物病毒攀木蜥蜴無碳能源控制變因原腎管分子證據種大腸癌第 I 型生存曲線萊爾倍增年數