酵素的一種。可辨識並切割特殊核苷酸序列（此序列特徵為具有對稱性）的酵素。 功能：保護細菌免受其他生物體 DNA 的入侵。 例子：大腸桿菌中純化出來的限制酶 EcoRI 即能辨識－GAATTC－的核苷酸序列， 並進行切割。
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