清兵入關以後，明朝宗室南逃，鄭經在西元 1864 年（明永曆 18 年）便迎寧靖王來臺。西元 1683 年（明永曆 37 年）鄭克塽降清，寧靖王與五位妃子便相繼殉國，後人便在此自盡處修築起墓塋與祠堂，此即為五妃廟。
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